La systématique est l’étude de la diversité biologique. Elle regroupe trois disciplines distinctes :

La Taxonomie a pour objet d’établir des groupes taxonomiques (taxons) sur la base de

critères suffisamment spécifiques pour leur permettre d’être à la fois reconnaissables et

distincts des autres groupes ;

La Nomenclature affecte à chaque taxon une dénomination conventionnelle ;

L’Identification permet d’intégrer des souches inconnues à l’un des taxons, préalablement

définis sur la base de la comparaison de leurs caractères spécifiques respectifs.

La classification des organismes supérieurs en espèces est relativement simple car basée sur

la description de caractères morphologiques généralement significatifs et sur la reproduction sexuée

(possible seulement entre individus de la même espèce = inter-fécondité). Ainsi, on peut distinguer,

par exemple, du premier coup d’oeil un lion d’un éléphant ou encore un pin d’un olivier. Mais chez

les procaryotes, la problématique de définition de l’espèce est plus complexe et différente.